Генбанк - Генетической Базе
Vadyan | Просмотров: 854
Результатом международного сотрудничества, Генбанк находится в свободном доступе и бесплатная в использовании база данных нуклеотидных последовательностей. Это позволяет простое управление и обмен данными нуклеотидной последовательности генерируются в лабораториях и виртуализации центров по всему миру, потому что наибольшие успехи являются результатом совместной работы. По состоянию на август 2013, Генбанк имеет коллекцию 16,72,95,840 последовательности нуклеотидных оснований 1,54,19,29,21,011!
За последние несколько десятилетий, ученые разработали методы, чтобы sequence геном несметное количество различных существ, включая человека. Потом они поняли, что они могут идентифицировать и управлять специфическими генами, чтобы достичь желаемых результатов, как улучшению здоровья, повышение продовольственного снабжения, природные пестициды, и гербициды, и т. д. Но, такие генетические манипуляции требует знания о соответствующих сегментов ДНК, вплоть до конкретных последовательностей. Так, что они делают? Последовательность все, прежде чем они его использовать? Нет. Они могут искать необходимую информацию последовательности в репозиторий под названием Генбанк, глобальной базы данных нуклеотидных.
GenBankGenBank представляет собой базу данных генов, грунтовки, и даже целых геномных последовательностей, и куратор и поддерживается национальными институтами здоровья (nih) в рамках международного сотрудничества Нуклеотидной последовательности с базой данных (характер). Генбанк осуществляет обмен информацией с банком данных ДНК Японии (в ddbj) и европейская Лаборатория молекулярной биологии Нуклеотид базе последовательности (ЭМБЛ-Банка), чтобы обеспечить доступность исчерпывающей информации по всему миру.
Основанная в 1982 году, с набором только 606 последовательности и оснований 680,338, Генбанк в два раза каждые 18 месяцев, и до сих пор продолжает расти. Сегодня, Генбанк содержит всех общедоступных последовательностей ДНК плюс Примечания, дающие дополнительную информацию о каждой последовательности. Так, например, если вам нужно найти сайты рестрикции, присутствующих на той или иной последовательности ДНК, вы можете просто обратиться к базе данных, посмотрите организма, и восстановить последовательность и соответствующих исследований, если таковые имеются. Если последовательность исследования заключается в том, что из распространенных и хорошо изученных организмов, там будут ссылки на исследования, которые обеспечивают более углубленную информацию, и вы можете даже найти точную информацию, необходимую.
AccessBecause цель Генбанк является поощрение научных исследований, она полностью открыта и может быть свободно доступна любому. Нет никаких ограничений на использование базы данных или информации, а сама база данных не совпадет с другими геномными поисковые системы и инструменты, как взрыв. Вы можете искать CoreNucleotide, который является основным банком, выразил Теги последовательности, или Геномные исследования последовательностей. Вы также можете скачать всю последовательность с помощью утилиты, нашел на сайте.
ResultsWhen вы нажимаете на результатах поиска, вы найдете идентификационную информацию, например имя организма, его местоположения в базе данных, и краткое описание записи. Вы также найдете длину последовательности―при открытой базе данных для представления целых геномов, каждая запись принимает только 350 Кб―и полные последовательности генома долго. Поэтому, когда ваши результаты, может быть много записей для организма, что вы ищете―каждый из них содержит другой последовательности, и вы должны определить, какой из них вам. Каждая запись говорит вам, какой тип молекулы упорядочены, так что вы точно знаете, какой тип ДНК или РНК ты смотришь на. В разделе 'определение' также будет сообщать вам, если какие-либо части последовательности кодирования, и нужно ли или не содержащую полную кодирующую область.
SecrecyAnother, что ваши результаты будут вам сказать, это имя исследователей, которые представили последовательность―материалы открыты, и исследования автора, информация отображается прямо на странице. Однако, если статья еще не опубликована, это может нарушать работу исследователей, если кто-то еще использует их данные для публикации первого. Следовательно, на момент подачи, Генбанк предоставляет возможность отложить проводок последовательности, но только в течение ограниченного периода времени.
Кроме того, во имя конфиденциальности, база данных не публикует какие-либо идентифицирующие сведения об источнике ДНК. Например, для ДНК человека, они скажут вам, что это человеческое, но имя отдельного донора ДНК не будет раскрыта. Потому что они в открытом доступе, да, но это только идет до сих пор.
Сотрудничество является ключом к научному прогрессу, а просто просматривают базу данных достаточно, чтобы сделать вас гордиться современной техники и скорость, с которой мы можем расшифровать информацию, заложенную в молекулах. Именно благодаря таким базам данных и соответствующих инструментов, что исследователи, которые живут далеко друг от друга и никогда не встречались, работать вместе и сотрудничать для достижения общей цели. Ведь научный прогресс не может быть достигнут без обмена знаниями.